Na medicina clínica, muitos distúrbios encontrados apresentam base genômica, como fibrose cística, distúrbios poligênicos e câncer hereditário, por exemplo. As novas tecnologias de sequenciamento transformaram a capacidade, velocidade e custo do sequenciamento do genoma, proporcionando avanços e oportunidades para aplicação na medicina clínica no sistema de saúde, porém, essa expansão requer novas infraestruturas.
Em dezembro de 2012, o Primeiro Ministro do Reino Unido, David Cameron, anunciou um programa de sequenciamento do genoma completo (WGS) como parte da Estratégia de Ciências da Vida do governo. O principal objetivo do Projeto 100.000 Genomas é sequenciar 100.000 genomas de pacientes com câncer, distúrbios raros e doenças infecciosas e vincular os dados da sequência a um relato padronizado e extensível de diagnóstico, tratamento e resultados.
O resultado desse projeto será disponibilizado para fins de pesquisa acadêmica e industrial, incluindo organizações clínicas contribuintes do sistema de saúde do Reino Unido. A Genomics England, responsável pelo projeto 100.000 genomas, trabalha com várias organizações da Inglaterra e da Irlanda do Norte, também com grupos de pesquisa e organizações de financiamento, para garantir que a nova capacidade de pesquisa seja adequada ao objetivo e que os dados sejam adquiridos e gerenciados de acordo com os padrões apropriados.
Para fornecer uma plataforma escalável de sequenciamento, a bionformática é essencial, pois permite que esse serviço seja amplamente disponibilizado no sistema de saúde. A Genomics England desenvolveu plataformas e automatizou pipelines para processamento, verificação de qualidade e armazenamento. Fornecendo acesso a recursos de dados, é possível desenvolver novos conhecimentos, métodos de análise, medicamentos, diagnósticos e dispositivos.
Este projeto poderá fornecer diagnóstico clínico e, com o tempo, tratamentos novos e mais eficazes para vários pacientes com alterações genéticas que causam doenças. Com o consentimento dos pacientes, há um banco de dados de sequências genômicas continuamente atualizadas ao longo do tempo com informações para análise por pesquisadores.
O projeto 100.000 genomas apresenta três pilares principais:
- Doenças raras: que recrutou pessoas com doenças raras e seus familiares para identificação de variantes genéticas que causam a doença;
- Câncer: recrutando pacientes com câncer de pulmão, mama, cólon, próstata e ovário, para identificar mutações causadoras de câncer e entender a genética evolutiva da doença;
- Doenças infecciosas: sequenciamento realizado em patógenos (vírus e bactérias) para fornecer informações sobre espécies, virulência, transmissão e resistência antimicrobiana, que podem ser utilizadas também para controles de infecções.
Em abril de 2018, mais de 70.000 participantes foram recrutados para o projeto e mais de 55.000 genomas foram sequenciados, com mais de 10.000 relatórios com análise de genomas completos devolvidos ao sistema de saúde. Esse projeto acelerou a evolução de infraestrutura de informática, desenvolvimento de pipeline de dados e desenvolvimento de tecnologia e de especialistas. Ao final do projeto, o serviço fornecerá sequenciamento completo do genoma centralizado e credenciado no sistema de saúde com captura de resultados permitindo uma evolução contínua dessa iniciativa.
O Projeto 100.000 Genomas foi concluído no final de 2018, com 100.000 sequências alcançadas. Foram realizadas descobertas em 1 paciente a cada 5 participantes com doenças raras, e em aproximadamente 50% dos casos de câncer apresentaram uma terapia potencial. Muitas histórias de pacientes relevantes para o estudo, como aqueles diagnosticados e que apresentaram uma terapia em potencial, foram divulgadas em artigos ou no próprio site do projeto, mostrando a importância do projeto na vida dos pacientes que participaram. Além disso, o projeto foi a base para aplicação da técnica de sequenciamento completo de genoma no sistema de saúde, fornecendo cada vez mais diagnósticos precisos e terapias direcionadas, melhorando a qualidade de vida de muitos pacientes.
Referências bibliográficas:
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